En los últimos años se ha expandido el conocimiento de este tema tan fascinante. En resumen, es un grupo de microorganismo vivos que residen en el sistema digestivo y cuya función es el adecuado funcionamiento corporal, inmunidad y nutrición. En el pasado con las técnicas de cultivo solo podíamos identificar un diminuto número de estos microorganismos y sus interacciones.  Con el advenimiento de técnicas moleculares de metagenómica y 16s rRNA se conoce un número cada vez mayor de microorganismos, al punto que en la última década se han descubierto más de 250 nuevas especies.

A las alteraciones de esta microbiota intestinal y la respuesta adversa del cuerpo se le denomina disbiosis. El SIBO o sobrecrecimiento bacteriano de intestino delgado es un tipo de disbiosis donde las bacterias proliferan como se dijo en el intestino delgado y su diagnóstico y tratamiento se ha vuelto relevante.